105年清明節連續假期海運交通疏運期程為105年4月1日至4月6日共計6日，預計提供臺灣本島與離島間7條航線及金馬小三通4條航線，總計開航1,219班次，預估可提供28萬318人次運能。
交通部航港局對於轄管離島及小三通客輪之載客運能及航行安全極為重視，除因應清明節連續假期之運輸需求，協調業者加開航班，以疏運旅客，並派員前往各地客船碼頭，加強載客船舶救生、救火、救難設備檢查及查驗其演習情形，嚴格要求業者注重航行安全，不得超載旅客，以維護旅運安全。
疏運期間遇不可抗力因素致載客船舶無法航行時，該局各航務中心除要求業者於營業處、候船室等處所張貼公告，並以網路、廣播等多媒體方式對外公布，方便民眾掌握訊息，同時啟動海空聯繫機制，請交通部民用航空局協調加派班機疏運旅客。
航港局提供緊急連絡電話：北部航務中心02-89783530、南部航務中心07-2620580、中部航務中心082-398021或082-398011、東部航務中心03-8509011，以即時處理疏運期間突發狀況及緊急事件，提供旅客良好服務、保障消費者權益。相關海運航班訊息，民眾可至航港局資訊網（http://www.motcmpb.gov.tw/）查詢，預先安排清明節假期間返鄉及出遊行程，期使每位民眾都能如期返鄉、平安而歸。