花蓮幼鴨、宜蘭鴨隻、台南火雞陸續驗出感染H5N6禽流感病毒後，行政院於昨(12)日成立「禽流感中央災害應變中心」，今(13)日也召開第1次會議，由農業委員會主任委員林聰賢擔任指揮官，並由行政院政務委員、衛生福利部部長陳時中及環保署署長李應元擔任協同指揮官。值得注意的是、動植物防疫檢疫局更進一步證實，由於之前各國從沒有火雞遭到感染的情形，這也可能是世界首例火雞感染禽流感的情況。
今(13)日行政院長林全也親自主持禽流感中央災害應變中心會議時，表示病毒是否禽傳人，目前還無法斷定，但未來政府將防疫視為全國性的作戰。農委會也在會議上也討論到H5N6禽流感防疫策略，農委會林主委指示在縣市成立指揮中心、各縣市也儘快對轄內飼養家禽清查訪視及研議是否對發生縣市的家禽就近屠宰等防疫提議；另外，為提高農民主動通報意願，也請農委會儘快研議提高撲殺補償費。
若經研判未來疫情如有升溫趨勢，農委會也需要提升管制措施，例如：家禽禁止移動或禁宰措施等；會議上、更請各縣市政府加強違法屠宰查緝，以避免疫情擴散。
農委會表示，花蓮縣玉里監測管制範圍由原本半徑3公里擴大至5公里，並提高監測頻度由原本每月1次縮短至每半個月1次，連續3個月確認未檢出禽流感病毒活動後，才解除該地區的監控措施，且該半徑5公里內的養禽場，須經首次檢測無病毒存在後，才可上市屠宰。
而2月21日以前，除水禽外，同時禁止陸禽運出花蓮縣以往屠宰；宜蘭縣已完成花蓮運往屠宰場屠宰並檢出H5N6禽流感鴨隻3,787隻屠體廢棄，屠宰場周圍半徑3公里內禽場管制監測，僅1禽場，目前空舍當中；至於台南市的部分已由該市動物防疫保護處對案例場周圍半徑3公里內禽場採取管制及監控措施，半徑3公里至5公里進行全面訪視，並優先對鴨隻採樣監測，以確認病毒是否有擴散跡象。