中央研究院長翁啟惠捲入浩鼎案，引發重大爭議。在昨天一場座談會中，學者形容現在的中研院「銅臭味十足」，翁啟惠到文科研究所訪視時甚至也問：「有哪些是可以申請專利的？」他們痛批，浩鼎案是「學術界的國恥」。
學者組成的教改論壇昨召開「誰砸了中研院的招牌？」記者會，前東吳大學校長劉源俊說，翁啟惠關於醣分子的研究相當卓越，但這樣優秀的科學家來主持大型研究機構的行政，則是糟蹋人才。如今翁啟惠不但自陷絕境，也將中研院拖下水。
劉源俊說，中研院以前一向重視基礎科學研究，但近年建立「智財技轉處」推動產學合作，這雖有必要，但不能喧賓奪主。一些人文組院士就說，翁啟惠接任院長後到各研究所訪視，連在文科所也問「有哪些東西可以申請專利」，銅臭味十足，「向錢看」的態度讓人無法認同。
台師大特教系榮譽教授吳武典則說，最近10於年來，中研院對產業的關懷和介入愈來愈深，所得的資源和利潤也愈來愈多。社會已難要求中研院成為政治和產業的絕緣體，然而也不願意看到它成為政治舞台與炒股中心。
吳武典主張，未來中研院長人選，應避免兼任重大研究案主持人，不要跟大家搶資源，也免除瓜田李下、球員兼裁判之嫌。如果是傑出科學家、正值學術壯年，那就好好從事研究，比來當院長好。
台大心理系教授黃光國指出，「冰凍三尺非一日之寒」，浩鼎案的出現顯示國內學術風氣的腐化。
政大教育系教授周祝瑛則說，翁啟惠捲入浩鼎案是「學術界的國恥」，中研院雖屬於總統府底下的機構，但卻常常「無法可管」，院長更是「一人之下、萬人之上、不受監督」，即使總統也不敢管。此外，中研院院士選舉總是「近親繁殖」，早已失去學術反省能力。
