交通部路政司簡任技正胡迪琦表示，《公路法》修正實施後，未依法申請核准，經營汽車運輸業或計程車客運服務的業者，依情節輕重可處罰鍰10萬至2500萬元，並可勒令歇業；過去可吊扣吊銷非法營業的車輛牌照，修法後還可吊銷駕駛人駕照。
依據不同經營業態有不同裁罰基準，對於個人部分，以小型車、機車經營汽車運出業者，第一次遭檢舉將開罰10萬元，並吊扣牌照及駕照4個月，第二次被抓到罰12萬、吊扣牌照及駕照6個月，第三次罰14萬、吊扣牌照及駕照8個月，第四次罰16萬、吊扣牌照及駕照一年，若第五次以上或半年內連續被抓到兩次，處新台幣20萬元，並吊銷牌照及駕照。
個人以大型車經營汽車貨運業，第一次遭檢舉將開罰12萬元，並吊扣車輛牌照及駕駛人駕照4個月，第二次被抓到罰15萬、吊扣牌照及駕照6個月，第三次罰18萬、吊扣牌照及駕照8個月，第四次罰21萬、吊扣牌照及駕照一年，若第五次以上或半年內連續被抓到兩次，處新台幣30萬元，並吊銷牌照及駕照。
個人以大型車經營公車遊覽車客運業，裁罰基準以5萬為級距，第一次開罰15萬，並吊扣牌照、駕照5個月，第二次罰20萬並吊扣牌、駕照8個月，第三次罰25萬並吊扣牌照、駕照一年，若被抓第四次以上或半年內累犯，處50萬並吊銷牌照、駕照。
至於公司（法人、非法人團體）非法經營汽車客運業，第一次被取締開罰100萬，裁罰級距為500萬元，罰到第6次或半年內連續違規3次，將處2500萬元罰鍰。
而檢舉獎金部分，胡迪琦表示，訂定辦法需要一段時間，交通部將參考像《食安法》等有檢舉案例的既有法規來擬定，一般法規預告通常需要60天，最少可縮短到14天，交通部將朝縮短至14天盡速辦理。雖然檢舉獎金發放辦法最快要到農曆年後才會公布，但其生效日會追溯到《公路法》修正的生效日，因此檢舉人領獎金的權益不會受影響。